但是即使沒(méi)有這些資質(zhì),測序服務(wù)機構也能以科研報告的形式提供檢測服務(wù)(規避醫學(xué)檢驗的限制),或者與試點(diǎn)醫院成立聯(lián)合實(shí)驗室,享受利潤分成。
這些都折射出當前我國基因行業(yè)監管的不成熟,美國臨檢機構采取的是CLIA/CAP認證的形式,很大可能我國未來(lái)也會(huì )采取類(lèi)似的認證資質(zhì)。
應用領(lǐng)域的監管:目前高通量測序臨床上的應用還只能試點(diǎn)應用于遺傳病診斷、產(chǎn)前篩查與診斷、植入前胚胎遺傳學(xué)診斷和腫瘤診斷與治療四個(gè)專(zhuān)業(yè)方向。
但是在心血管領(lǐng)域、感染性疾病、腸道微生物宏基因組學(xué)等領(lǐng)域,二代測序都有良好的應用前景,當前的臨床高通量測序試點(diǎn)只是LDT試點(diǎn)在某個(gè)專(zhuān)業(yè)方向的具體應用,未來(lái)應用領(lǐng)域會(huì )越來(lái)越廣。
儀器試劑的監管:由CFDA進(jìn)行審批,高通量測序中需要申報的有測序儀(綁定上機試劑)、建庫試劑盒、檢測試劑盒、分析軟件等。
NIPT方面,CFDA先后批準了華大基因(BGISEQ-100基于life的Ion Torrent技術(shù)、BGISEQ-1000基于華大基因之前收購的Complete Genomics的測序技術(shù))、達安基因(DA Proton基于life的Ion Torrent技術(shù))、博奧生物(BioelectronSeq 4000基于life的Ion Torrent技術(shù))、貝瑞和康(與Illumina合作的NextSeq CN500)的NIPT二代基因測序儀和配套試劑(13、18、21號染色體三體檢測試劑盒、上機測序試劑);
在腫瘤方面,目前目前還沒(méi)有高通量測序儀和高通量檢測試劑盒獲批,試點(diǎn)單位只能以自制試劑(LDTs)的形式開(kāi)展檢測服務(wù)。
從長(cháng)遠來(lái)看,多目標基因panel(幾十上百個(gè)基因或靶點(diǎn))高通量檢測試劑盒基本沒(méi)有獲批的可能,因為位點(diǎn)突變率很低,很難找到足夠的病人開(kāi)展臨床試驗,并且檢測結果也無(wú)法去驗證,所以這類(lèi)試劑盒只能以L(fǎng)TDs的形式在臨檢實(shí)驗室使用,無(wú)法外售;
而少量目標基因(數個(gè)基因,少量突變位點(diǎn))的檢測試劑盒可能會(huì )被CFDA審批,但是從檢測成本來(lái)說(shuō),少量目標基因的檢測成本不會(huì )比多目標基因檢測低,所以終端價(jià)格相差不大,當與多目標基因panel一起進(jìn)行市場(chǎng)推廣的時(shí)候,并不具有優(yōu)勢。
總結:當前國內高通量測序在臨床上的應用監管還很不成熟,試點(diǎn)名單是名義上具有出具臨床檢驗報告資質(zhì)的機構,并不是其他機構開(kāi)展測序服務(wù)的限制條件(能以科研的形式開(kāi)展服務(wù)),儀器、試劑的審批也不具備限制性,市場(chǎng)處于洗牌階段,基因檢測公司需要積極進(jìn)行兩手準備,一方面籌備臨檢資質(zhì)的申報,積極布局醫院終端,一方面著(zhù)手儀器、試劑的審批。我國未來(lái)可能采取和美國類(lèi)似的CLIA/CAP審批,優(yōu)先布局醫院渠道的有望受益。
案例(美國CLIA認證):
在美國,只要通過(guò)了CLIA(Clinical Laboratory Improvement Amendments,臨床實(shí)驗室改進(jìn)法案)認證,第三方實(shí)驗室就可以根據市場(chǎng)需求,開(kāi)發(fā)出各種新的診斷試劑或服務(wù),即自建項目或者自制試劑(LDTs)。
這種檢測只能在該實(shí)驗室內使用,不能外傳或者出售給其他任何實(shí)驗室或者醫療保健機構,從而將風(fēng)險控制在有限的范圍,因而不需要FDA的批準。同時(shí),由于CLIA認證的是實(shí)驗室,所以并不需要對每個(gè)新服務(wù)或產(chǎn)品作出審批申請。醫院或者病人可以根據自己的需要,選擇相應的診斷項目。這個(gè)政策給了第三方實(shí)驗室極大的自由空間,也帶來(lái)了美國獨立實(shí)驗室的繁榮發(fā)展。
CLIA 認證最獨特的地方在于,實(shí)驗室自建項目即使在沒(méi)有FDA批準的情況下,也完全可以在其實(shí)驗室范圍內提供分子檢測業(yè)務(wù)來(lái)指導臨床。只要是有CLIA執照的實(shí)驗室,他們自己研發(fā)的制劑、技術(shù)等也可以合法地進(jìn)入臨床,合理收費。
這樣做的好處就是:在巨大的醫療需求、和日新月異的新技術(shù)面前,所有的CLIA實(shí)驗室可以跟據市場(chǎng)需求,快速地開(kāi)發(fā)出各種新的診斷應用。同時(shí),美國政府不必對應接不暇的每個(gè)新應用做出回應。而病人可以根據自己的需要,即時(shí)得到新的診斷服務(wù)。同時(shí)FDA可以選擇FDA認為真正好的診斷方法做進(jìn)一步認證,并以FDA的名義發(fā)布認證,以加速FDA認為好的診斷方法在市場(chǎng)上的應用。申報企業(yè)只要通過(guò)了CLIA認證,并能保證產(chǎn)品的質(zhì)量,那么就可以直接應用于臨床上。
二、基因測序的行業(yè)焦點(diǎn):重在服務(wù)
基因測序重在服務(wù),很難單獨依靠商品(檢測試劑盒、芯片)來(lái)建立優(yōu)勢,這與免疫診斷、化學(xué)發(fā)光有所不同,因為基因檢測歸根結底都是DNA一級序列的檢測,與二級、三級結構無(wú)關(guān),檢測原理相對簡(jiǎn)單,都是通過(guò)DNA引物靶定待測序列,然后通過(guò)引物延伸來(lái)實(shí)現序列的測定;相反,樣品DNA的提取、建庫和捕獲的操作倒是比較繁瑣,需要專(zhuān)業(yè)的技術(shù)人員去操作。
上游儀器已然被少數幾個(gè)公司所壟斷,中上游的試劑盒產(chǎn)品并不具有很高的技術(shù)壁壘(當然如果能在建庫環(huán)節和捕獲環(huán)節形成明顯技術(shù)優(yōu)勢,或者是開(kāi)發(fā)出效率更高的工具酶,也是很有發(fā)展前景的),而且高通量基因檢測試劑盒的審批存在較大的不確定性(未來(lái)可能參照美國CLIA認證的方式,具有資質(zhì)的檢測機構以L(fǎng)TDs自制試劑的形式使用,但是不通過(guò)藥監局的審批就無(wú)法對外銷(xiāo)售),醫院樣本量有限,先進(jìn)入的肯定會(huì )占據諸多優(yōu)勢,NIPT市場(chǎng)已經(jīng)接近飽和,腫瘤醫院的爭奪也日趨白熱化,所以率先通過(guò)服務(wù)來(lái)?yè)屨际袌?chǎng),這或許是較為穩妥的選擇。
醫院是否會(huì )自行購置測序儀開(kāi)展高通量測序?如果醫院自己測序,那么臨檢測序機構勢必難以競爭,所以思考這個(gè)因素是有必要的。這個(gè)問(wèn)題要分開(kāi)來(lái)看,一方面考慮用戶(hù)的數量和需求,一方面考慮測序成本。以當前高通量測序用的最廣泛的是NIPT和腫瘤診治為例進(jìn)行分析:
在無(wú)創(chuàng )產(chǎn)前診斷領(lǐng)域,我國每年的新生兒在1500萬(wàn)人左右,潛在客戶(hù)基數大,NIPT能夠給出明確的診斷結果和對應的防治措施,而且結果關(guān)系到下一代的健康,檢測價(jià)格在2400元左右,受眾廣泛;
此外,NIPT對測序的精度要求不是特別高(目前主要是針對13、18、21號染色體的三體檢查),檢測是一個(gè)定量的過(guò)程,通常采用life ion torrent平臺(目前獲批的5款儀器里面3家申報的是ion torrent,而且美國已經(jīng)有機構采用基因芯片來(lái)做NIPT),很多大型醫院能夠自行開(kāi)展NIPT服務(wù),第三方測序機構的目標市場(chǎng)應該在中小型醫院。
但是高通量測序在腫瘤領(lǐng)域的應用就不太一樣,我國每年新增腫瘤患者在450萬(wàn)人左右,腫瘤panel測序的價(jià)格在8千到2萬(wàn)之間,而且現在做腫瘤panel測序的患者主要目的是獲得靶向藥物用藥指導,靶向藥物價(jià)格比較昂貴(每個(gè)月的用藥開(kāi)銷(xiāo)在5萬(wàn)左右),所以目標人群就更加狹窄了;
此外,腫瘤檢測對測序精度要求比較高,主要針對點(diǎn)突變或者微缺失微重復,對技術(shù)平臺的要求高,通常采用Illumina Hiseq/next Seq測序儀,儀器設備昂貴,并且開(kāi)機試劑耗材的花費高(一次開(kāi)機在15萬(wàn)左右),如果沒(méi)有足夠的樣本量,基本上每次開(kāi)機都是虧損;
并且腫瘤數據的分析比較復雜,需要專(zhuān)門(mén)的生物信息學(xué)人才和數據庫,所以在腫瘤領(lǐng)域(在其他病患更少的領(lǐng)域更是如此),我們認為高通量測序還是以第三方臨檢機構為主,目標市場(chǎng)在大型醫院。